在全基因組中尋找一段特殊序列就好比從十億個拼圖中尋找到一塊特殊的拼圖,近日一篇刊登在雜志Nature Communications上的研究論文中,來自伊利諾伊大學的科學家們通過利用的成像技術揭示了一套基因編輯蛋白如何尋找到自己的特殊靶點,從而幫助設計治療人類疾病的特殊基因療法。
TALE蛋白,或稱為轉錄激活因子樣效應蛋白,其可以按照程序來識別并且結合到DNA的特殊序列上,研究者非常感興趣利用TALE蛋白來進行合成生物學研究,比如對植物或細菌進行基因編輯,或用于基因療法研究等,研究者Zhao就利用TALE蛋白來治療鐮狀細胞性貧血,該病是由DNA鏈的一個突變所引發(fā)。
研究者指出,很多人都會利用TALE蛋白這種新型技術,但很少有人知曉其作用機制,本文中研究者利用成像技術就可以在顯微鏡下觀察到單一的TALE蛋白如何同一串DNA進行相互作用,研究者發(fā)現TALE蛋白會利用滑動和跳躍的模式相結合來尋找靶點,TALE蛋白結合到DNA上并且會沿著螺旋線滑動,在DNA分子“高速"路上移動,同時這種蛋白還會在DNA分子上進行頻繁地跳躍,以使其可以更加快速地移動。
這種滑動和跳躍相結合的模式就可以幫助TALE蛋白作為DNA雙螺旋的開關,從而更加快速地尋找到自己的作用靶點,研究者Schroeder博士指出,我們的主要目標就是工程化改善蛋白質使其脫靶率降低,下一步我們將觀察TALE蛋白如何在活細胞中發(fā)揮作用,來觀察當該蛋白浸入在細胞活動中后其行為的改變。